1、转变观念水利工程的管理者在思想观念上要与时俱进，不断改变不适合当前水利工程顺利开展的旧思想、旧习惯，把工程建设的重点转移到工程质量管理上，确立质量与管理并重的思想。在工作中要有创新精神，利用经济、法律、行政等多重手段加强工程建设管理。不断学习先进的管理知识，根据具体工程的特点，采用先进的理念，去探索适合具体水利工程的管理方法。此外，目前我国水利工程建设正处于高速发展阶段，还应考虑注重生态保护，减少水利工程对自然环境的影响。因此，要从过去单一的防灾减灾T程建设转变为结合生态保护的多目标综合治理，探索人与自然和谐相处的可持续发展水利管理模式。
2、加强科学管理随着科学技术的发展和现代网络的普及，当前水利工程管理也实现了自动化。在具体的水利工程建设中采用网络化、智能化的现代管理手段，不仅可以精简多余的管理机构和人员，还能实现工程管理规范化。适时将现代化科学管理模式运用于水利工程管理巾，开发工程管理预警系统，提高工程管理的科学性。此外，现代的水利工程企业要注重人才的作用，积极培养和引进一批高素质复合型水利工程管理人才，并定期对现有管理人员进行培训，使其掌握现代化的相关工程管理知识，提升其素质和管理水平，达到加强水利工程管理的目的。
3、加强管理资金投入大多数水利项目投资都是只考虑工程建设的投入，建成之后的维护预算并未考虑，导致很多中小型水利工程无管理经费，设备老化，年久失修，存在很多的安全隐患。为此，在进行防洪防涝等活动中，水利管理单位要花费大量的人力、物力和财力，给水利管理单位的运营造成巨大的资金缺口，等待国家的财政补贴。另外，鉴于水利管理单位属于服务型单位，没有自己的财政来源，以及水利工程对于社会生活的正常运转具有特殊性。政府需要加大财政支持力度，以便于水利工程管理部门进行日常的检查维护等工作，确保水利工程安全运转。
4、强化工程安全管理意识水利工程是社会发展和国民经济的基础设施和基础产业，确保水利工程安全、正常运转、充分发挥水利工程的经济效益是水利职工义不容辞的责任。水利工程管理部门必须强化管理意识，建立健全水利工程管理机构和管理体制。将安全生产作为管理工作的第一要务，并制定严格的责任制度，对出现的安全问题要切实追究相关人员的责任。除了进行工程管理的制度化、规范化等规章制度建设外，还要加强对水利工程管理员工安全意识培养，确保水利工程安全运行。
5、加强用水管理，注重节能减排水利工程建设完成后，如何有效利用水资源将是一个首要问题。首先要实行计划制度，也就是结合当地的实际情况、水源情况、工程条件、工农业生产安排等方面编制用水计划，制定工作方案、计划表、工作图等，有计划进行蓄、引、提、调和分配水量。在遵守节约用水的前提下，使水资源得到最大化利用是重中之重。其次，在水利灌溉方面，应根据灌区的特点进行灌、排试验研究工作，了解作物需水量和田间排水效果，达到节约用水的目的。此外，还要增设引水渠道防渗措施，减少水量损失。
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